注意：要达成完美欢乐结局，故事模式下的每关需要达成以下的条件。如果没有达成，请在剧情模式（继续剧情）下选择该任务，再选“倒回故事”来修复故事链，而不是在主菜单下选重玩任务，那样是没用的。切记，切记！
第1关：浴血胜利（Pyrrhic Victory）
时间地点：安哥拉 1986
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扮演角色：艾历克斯·梅森
任务目标：拯救伍兹
每个关卡都有10项挑战任务，只须完成其中的5个就能解锁一把新武器。下面列表是所有挑战任务的达成条件，标注◆是稍高难度的挑战，而◇是稍低难度的挑战请优先达成。
本关的挑战
1
◇
用战刀杀死15名敌人。游戏开始梅森就持有战刀，在敌人身前按V键斩杀。
2
◇
摧毁所有的MPLA装甲。在武装直升机上，用火箭摧毁所有标注的坦克单位。
3
◆
用一发迫击炮弹轰杀5名敌人。迫击炮弹在开始的战场，靠近倾覆的装甲车和情报的地方。
4
◇
击沉5只敌军船只。在河上的驳船甲板，使用机枪摧毁敌人的船只。
5
◆
躲避敌人的手榴弹并生还。按卧倒（C键）躲避。
6
◆
用捕兽夹杀死10名敌人。梅森使用开锁工具进到工具屋可找到捕兽夹。
7
◇
用迫击炮弹和捕兽夹制成的简易地雷杀死4名敌人。在设置好捕兽夹后，在上面再放一颗迫击炮弹，制成简易地雷。
8
◆
在简易狩猎台上射杀20名敌人。在梅森、伍兹和霍德森逃往下游的时候，沿途有5座简易的狩猎台，躲在上面击杀敌兵。
9
◇
收集所有的情报。
10
◆
一命过关。
梅森正在休假，美国国家安全局的诺斯和中情局的哈德森赶来请他归队，说伍兹在昨天带领一支小队捣毁位于安格拉的武装走私集团，失去了联系。
关卡开始在非洲安格拉的战场，梅森眼瞅着一名战友被烧死在封闭的房间里却无能为力，从萨维比的手里接过战刀，跳上装甲车前行。跳下战车，用手中的枪清掉几名近身的敌兵，然后往右侧找到一辆倾覆燃烧的战车，打开后门拾取迫击炮弹，在旁边的弹坑里拿到情报（1）。
往前射杀迫击炮小队的4名敌兵，然后按1键呼叫空中支援，控制哈德森的直升机发射火箭摧毁所有标注的装甲车。此时战场上出现敌军的机枪手，使得直升机无法低空飞行。梅森将两名机枪手解决，再次呼叫空中支援将战场上的所有装甲单位清除。跳上萨维比所乘的装甲车，敌军纷纷败退。
击沉5艘敌军船只，将甲板上的敌兵清理掉，爬到上层甲板，在墙角拾取情报（2）。在下层甲板打开集装箱，从腐烂的尸体中找到奄奄一息的伍兹。这时空中飞来一架雌鹿直升机，到集装箱左边拾取女武神火箭发射器，发射火箭按住鼠标左键引导轰毁直升机。
继续往河流的下游撤退，跳落一道瀑布，转身抵御追击的敌兵，这里仍有狩猎台可以利用。最后逃至河边遇到接应的萨维比，关卡结束。
第2关：铈元素（Celerium）
时间地点：缅甸 2025
扮演角色：大卫·梅森
任务目标：获取稀土元素
本关的挑战
1
◆
在敌人的直升机起飞前摧毁之。黑掉第二架直升机（靠近第一份情报的地方）得到火力支持，摧毁敌人的直升机。
2
◇
用EMP让2座岗哨枪塔失效并摧毁之。
3
◆
使用提图斯爆炸弹的副攻击模式，一弹杀死4名敌兵。
4
◇
使用直升机的机枪杀死10名敌人。在马来岛秘密基地的停机坪找到直升机，黑掉它并使用上面的机枪歼敌。
5
◇
使用隐形衣射杀30名敌人。带着开锁工具在研究所的入口处找到隐形衣（光学伪装战斗服），穿上它对敌人展开杀戮。
6
◆
引爆氮气罐来摧毁2只敌军的自动防御机器人（ASD）。氮气罐会瞬间冻结之。
7
◆
使用防暴盾牌杀掉10名敌人。防暴盾牌可以挡住敌人的子弹，摸到敌人身边肉搏格杀之。
8
◇
保护己方的自动防御机器人（ASD）不被毁灭。在梅森黑掉一只机器人后，保护它直至任务结束。
9
◇
收集所有的情报
10
◆
一命过关
◆为稍高难度，◇为稍低难度
时间到了2025年，扮演的角色换成了代号“断戟”的小梅森（大卫），使用的全是高科技装备，什么隐身衣、滑翔服在本关都会见识到。关卡开始小梅森手上戴的就是《谍中谍4》里汤姆克鲁斯爬迪拜高塔所用的壁虎手套。
风雨交加，和哈普身在绝壁之上，按屏幕的提示给哈普打手势，使用QTE指令往绝壁的下方跳下去。鼠标右键打手势，按A键摆动绳子，再按空格跳下去，同时按住鼠标左右键攀附到岩石上，这个步骤要重复进行三次，最后落身一道悬崖和萨尔拉扎、克罗斯比会合。
站到崖边，按鼠标左右键打开滑翔服，纵身跳下山崖。在空中滑翔，用滑动鼠标调整方向，躲避沿途的山脉和岩石，穿过一道拱洞听到提示，立刻打开降落伞飘落到对面的山崖上。
和战友一道杀进敌人的基地，来到停机坪，由左侧快速跑第二架直升机，黑掉它操作上面的机枪清理附近的敌兵，摧毁其它的载具，包括另一架直升机，清完场在旁边的屋子里收集情报（1）。
往前到一道拱门处，这里熟悉手雷的运用，按住鼠标中键调整投掷的轨迹，松开按键投掷。默认4键是EMP手雷，能使隐身衣失效。往前有三座自动岗哨枪塔，用EMP手雷能使它失败，上前将之摧毁。
进到废墟通道，墙壁上有些炸药包，击爆它们。来到神庙的大门前，炸开大它进到内部。古老的神庙深处居然是一座现代化的研究所，在入口走廊的右侧箱子里有件隐身衣，往前到大厅触发战斗，这里有两只自动防御机器人，它们有较强的火力，有的甚至能发射导弹，用EMP手雷来瘫痪，或者射击附近的氮罐来冻结。清完敌兵，进到左侧办公室从桌上拾取情报（2）。
沿着底层的走廊和房间清扫过去，找到电梯下去。来到底层大厅优先清掉自动防御机器人，射击氮罐来冻结它。在左侧的舱室里释放出一只机器人，保护它到关卡结束不被摧毁，可达成一项挑战。听到有奇怪的人声，循声打开储藏柜，找到名叫埃里克的磁力科学家，他被梅南德斯抓来处理一种新的稀土元素－铈。
此时大批的敌兵闯入，优先摧毁对面空中的枪塔和地面上游走的自动防御机器人，用氮罐来解决机器人。清场后前往敌人涌现的办公室，从桌上拾取情报（3）。
回去和埃里克一道开启大门进到实验室里，从埃里克手中拿到铈元素制成的量子设备，梅南德斯若用它制造恐怖袭击的话，没有任何人能阻止一场灾难。敌兵来袭，埃里克被一弹击杀，小梅森于是和队友杀出实验室，在走廊遇到救援的布里吉斯上将，将身上的铈元素装备交到他的手里。
第3关：往日旧伤（Old Wounds）
时间地点：阿富汗 1986
扮演角色：阿历克斯·梅森
任务目标：收集关于梅南德斯的情报
本关的挑战
1
◆
使用长剑斩杀15名敌人。这把剑在关卡开始梅森遇到赵天的地方，先别上马，往右匹旁边的石后走，从骸骨上拔出这把锈剑。
2
◇
用迫击炮摧毁敌军的直升机。使用开锁工具进到圣战组织首领驻地找到迫击炮弹，从基地的前门策马前奔，等身后空中出现俄军的直升机，投掷迫击炮弹摧毁之。若错过此次机会，等赶到弹药补给点附近的绳桥处再扔。
3
◇
用反坦克地雷来摧毁一辆装甲车。反坦克地雷来自锁住的箱子，在西部阻击点的武器箱，要摧毁的目标是BTR装甲车或T-62坦克。
4
◇
骑马撞飞10名敌人。
5
◆
使用卡车上的机枪摧毁一架敌军的武装直升机。
6
◆
在赶到基地前，在北部通路摧毁敌军的4架直升机。
7
◇
不使用毒刺火箭发射器的对空锁定模式摧毁一架直升机（使用手动瞄准模式）。低空飞行的直升机或炮艇是最好的目标。
8
◆
使用毒刺火箭发射器的副攻击模式消灭25名敌人。
9
◇
收集所有情报。
10
◆
一命过关。
◆为稍高难度，◇为稍低难度
梅森和伍兹赶往阿富汗，调查梅南德斯和苏联人的关联。见到赵天，他答应带两人前去见圣战组织的首领，从那里能找到梅南德斯的下落。
跟随赵天沿峡谷前行，在经过绳桥时注意左侧有道洞穴，洞口有情报，目前还无法下马拾取。进入圣战组织的营地，在山洞里见到圣战组织的领袖拉曼，哈德森正和他讲条件，希望能得到有关梅南德斯的情报，拉曼则希望美国人能帮忙抵御俄国人的进攻。
从洞里的木箱上拾取情报（1），在洞穴口打开一道木门，拾取隐藏的武器－迫击炮弹。离开洞穴上马，赶到营地大门看到俄兵已经打了过来。此时不必与俄兵恋战，跟随伍兹和赵天赶往西部阻击点。在营地大门的正前方有座石头尖塔，旁边是小红旗和弹药补给箱，在小旗旁边拾取情报（2）。
西部阻击点是一片残垣断壁的村庄废墟，消灭散布其中的毛子兵，然后爬到岗楼拿到毒刺火箭发射器，用它摧毁闯进村庄的两辆装甲车，然后跑到村口埋置地雷，引爆它摧毁建筑，垒起一道壁障。返回峡谷从武器箱处拿毒刺火箭发射器，跳上马背往圣战组织的主营地走，摧毁徘徊大门前的两辆坦克，接着摧毁空中的两艘炮艇，若使用鼠标右键瞄准，成功的将炮艇摧毁则达成一项挑战。沿山谷开过来两辆坦克，同样用火箭弹摧毁之，这里顺手达成骑马撞飞10名敌人的挑战。
赶往东部夺取被俄兵占领的弹药库，就是绳桥那里。下马到洞穴口拾取情报（3），使用火箭弹摧毁空中盘旋的直升机，再居高临下轰杀谷中涌现的俄兵，达成用毒刺火箭发射器的副攻击模式消灭25名敌兵的挑战。
拿回弹药库后策马返回主营地，看到俄军的重装甲部队卷土重来，梅森和伍兹纵马扬沙，一往直前。不料座骑被流弹击杀，努力推开马尸，跳上伍兹的马匹跃身跳到俄军坦克上，将炮弹扔进坦克里，将俄兵首领克拉岑科生擒活捉。
剧情分歧点：
进入审讯环节，梅森有三次机会要开枪击杀克拉岑科，此时连按F键克制自己的冲动，让伍兹完成审问，得知中情局内部有卧底的事情，这样在第4关“时间与命运”中能找到一份情报。
伍兹（或梅森）将克拉岑科击毙，圣战组织的拉曼突然翻脸，将梅森、伍兹和哈德森一番暴打抛弃在荒漠中……
本关结束会出现两个突击部队任务：幽灵作战基地和海难，在进行剧情关卡之前请完成它们。
